आईपीएल में कोलकाता नाइट राइडर्स के लिए खेलने वाले वरुण चक्रवर्ती का स्टारडम एक समय लगातार बढ़ रहा था। उन्हें एक मिस्ट्री स्पिनर माना जाता था और उन्हें उनकी मिस्ट्री बॉलिंग के लिए ही ICC T20 वर्ल्ड कप 2021 में भारत के लिए खेलने का मौका दिया गया था। उस समय हरभजन सिंह, आकाश चोपड़ा, इरफान पठान और कई अन्य एक्सपर्ट्स ने ट्रॉफी जीतने के लिए उन्हें टीम में शामिल करने का समर्थन किया था।
हालांकि, वो केवल एक टूर्नामेंट तक ही टिक पाए और उन्हें टीम से बाहर कर दिया गया और फिर कभी उनके नाम पर विचार नहीं किया गया। 2020 और 2021 में आईपीएल के दौरान उन्होंने कोलकाता नाइट राइडर्स (केकेआर) के लिए अच्छे स्पैल फेंके। उन्होंने आईपीएल 2020 में 17 विकेट लिए और अगले सीज़न में 18 विकेट लिए। उन्हें वर्ल्ड कप में पाकिस्तान और न्यूजीलैंड के खिलाफ प्लेइंग इलेवन में शामिल किया गया था, जिस दौरान रविचंद्रन अश्विन बेंच पर बैठे थे।
इसके बाद वरुण को अगले दो मैचों के लिए प्लेइंग इलेवन से बाहर कर दिया गया और उसके बाद वो फिर कभी अंतरराष्ट्रीय क्रिकेट खेलने के लिए नहीं लौटे। वरुण के बाहर होने का कारण ये बताया गया था कि उन्हें चोट लगी थी, लेकिन अब कुछ सालों बाद उन्होंने सनसनीखेज खुलासा करते हुए कहा है कि वो चोटिल नहीं थे।